On distingue la flore transitoire, composée de microbes variant selon l'environnement (lieu de vie, profession, hygiène, vêtements, température, utilisation de cosmétiques), de la flore résidente qui réunit divers micro-organismes saprophytes, toujours identiques, mais répartis de façon différente selon les régions du corps, la présence ou non de plis, la densité des follicules pileux, glandes sébacées et sudoripares, l'âge et le sexe de l'individu. Ainsi, les bactéries ont une prédilection pour les zones humides (aisselles, plis de l'aine, narines ou paupières), tandis que les champignons apprécient particulièrement la plante des pieds, où l'on en recense une grande variété.